洁净室工程是一种新型国内工程技术，其中洁净室的要求与普通意义上的干净整洁是不同的，洁净室的洁净度要求是分子级别的，即对空间内的微粒、细菌、气体分子组成等都有严格的要求。有些行业必须应用洁净室工程才能生产出合格产品，而有些场所则被规定必须使用洁净室，下面介绍几种需要应用洁净室工程的行业。
一、电子工业
电子工业生产中的有些核心步骤必须在洁净室工程设备的保护下进行，例如大型集成电路的合成使用对空气中灰尘杂质含量要求很高，否则将会影响核心器件的精密度与灵敏度，直接导致产品不合格，此外如半导体、液晶屏、光盘等的制造也都对洁净室工程有着不同的标准。
二、医疗行业
医疗行业是一个与人们生活息息相关的特殊行业，洁净室工程在医疗行业应用也很广泛，首先是医院的手术室必须使用无尘无菌的洁净室，这是对病人及医护人员手术安全的基本保障措施，同时为了保证检查数据的精确性，某些特殊医疗器械也必须在无尘洁净室中使用。
三、食品行业
洁净室工程应用在食品饮料行业的市场潜能也很大，为了加强食品的安全卫生，其制造场所的洁净程度就必须提高，洁净室无菌生产在国外食品制造业应用已经很广泛，国内也会逐渐加强对食品安全的要求。
洁净室对分子级别的微粒控制严格，能创造一定空间的无菌环境，这能很好的解决困扰现代医疗手术中细菌感染的问题，同时无菌环境也是食品生产最安全的环境条件，食品卫生问题的解决离不开洁净室工程，其中电子工业无尘室是最常用的洁净室工程，电子产品质量的提升正是得益于这一技术。以上就是洁净室工程应用最为广泛的三个的行业。