制药厂洁净室地面材料的选择，药厂中较常见的是以下几种地面面层。
1、水磨石地面：优点是整体性好、光滑、不易起尘，可冲洗且防静电；缺点是无弹性。常用于要求经常擦洗的分装车间、针片剂车间、实验室、卫生间、更衣室、结晶工段等；
2、双层地面：可以地面回风，通气性好，造价高，弹性差舒适性好，常用于药厂的垂直单向流洁净室（大面积）；
3、塑料地面：光滑、略有弹性、不易起尘、易擦洗清洁、耐磨、耐腐蚀，但易产生静电，受紫外线照射易老化。因此不宜用于经常采用子紫外线灯灭菌的场所。一般用于更衣室、包装间、化验室等房间。由于塑料板与混凝土基层的伸缩性能不同，不宜用于大面积车间，否则会引起起壳现象；
4、涂料地面：具有水磨石优点，较耐磨而不耐拖拽，基底处理要求高，易卷边剥落，常用于药厂的洁净区；
5、耐酸瓷板地面：用耐酸胶泥贴砌，能耐腐蚀，但质地较脆，经不起冲击，破碎后则降低耐腐蚀性能。这类地面可用于原料车间中有腐蚀介质的区段，由于施工复杂、造价高，宜用于有腐蚀介质滴漏的局部范围使用。例如，将有腐蚀介质的设备集中布置，然后将这一部分地面用挡水线围起来，挡水线内部用此种地面铺贴；
6、卷材板材地面 ：光滑耐磨，略有弹性，不易起尘，易清洗，施工简易；易产生静电，受紫外灯照射易老化，大面积施工易起鼓，常用于药厂控制区；
7、玻璃钢地面：耐腐蚀，整体性好；易起鼓，宜小面积使用，常用于药厂原料车间有腐蚀的部位。
地面是制药厂洁净维护结构中最受重视的部分之一，在其地面材料的选型中，除了满足地面的共同要求外，亦应考虑地面的发尘量和施工难易程度以及成本等。
目前，制药厂洁净室一般选用整体性好、刚性强的水磨石地面。为了避免尘土、细菌积聚、滋生，这种地面必须防止开裂和返潮，在施工中可采取夯实回填土，加厚地坪、选用优质水泥（水泥砂浆基底的水泥标号不得低于425号），适当配筋（对打大面积厂房而言）等措施来防止地面开裂；为防止地面发潮，施工中则可采取加厚混凝土层和碎石层，湿度高的地方增加防水层（如一毡二油）等措施。有耐酸碱要求的地面，可以用聚氨酯、环氧树脂、过氯乙烯、乙烯、氯化橡胶、氯丁橡胶等涂料。有耐油要求的地面，可用环氧树脂、过氯乙烯、醇酸、硝基等涂料。在大多数的制药厂洁净车间，只要按照标准施工，保证水磨石地面的的质量，应不失为首选地面材料。