一、给水排水系统设计
由于大多数医学洁净实验室都是医疗大楼的一部分，因此的医学洁净实验室的给水、排水和气体供应的来源均为所在大楼的给水、排水和气体供应供应系统。医学洁净实验室的给水、排水和气体供应应该和大楼的给水、排水和气体供应供应系统可靠连接，并设置流量测装置，进出实验室的各类管道应该不渗漏、耐压、耐温、耐腐蚀。
实验室内应有足够的清洁、维修和维护明装管路的空间。实验室所使用的高压气体或者可燃气体应有满足规范要求的安全设施。实验区内尽量减少各类和实验室给水、排水和气体供应无关的管道穿越。
洁净医学实验室的给水应符合国家标准GB 5749《生活饮用水卫生标准》的要求。负压的洁净医学实验室的给水管路上应设置倒流防止器或者其他防止回流污染的装置，这些防回流装置应安装在易于检修、更换的位置。负压实验室的实验室内和紧急逃生出口处设置紧急淋浴装置。室内明装的给水管路宜采用不锈钢管路、铜管、无毒塑料管、管道的连接方式应该可靠。吊顶内安装的给水管道和管件，应选用不生锈、耐腐蚀和连接方便可靠的管材和管件，以满足净化要求。管道外表面可能结露时，应采取有效的防结露措施，防止凝结水对装饰材料、电气设备等的破坏。
洁净医学实验室的排水宜与其它生活排水分开设置，根据不同区域排水的特点分别进行处理。净化区内不宜穿越排水立管，如排水立管穿越屏障环境设施的净化区，则其排水立管应暗装，并且屏障环境设施所在的楼层不应设置检修口。排水管道应采用不易生锈、耐腐蚀的管材，可采用建筑排水塑料管、柔性接口机制排水铸铁管等。高压灭菌器排水管道最好单独排出室外，采用金属排水管、耐热塑料管等。洁净医学实验室的地漏应采用密闭型，以防止不符合洁净要求的地漏污染室内环境。
二、消防系统设计
洁净医学实验室的消防要满足国家相关消防规范的规定。洁净医学实验室的耐火等级不应低于二级，或设置在不低于二级耐火等级的建筑中。二级耐火等级基本适合屏障环境设施的耐火要求，故要求独立建设的该类设施其耐火等级不应低于二级，当该类设施设置在其它的建筑物中时，包容它的建筑物必须做到不低于二级耐火等级。具有防火分隔作用且要求耐火极限值大于0.75h的隔墙，应砌至梁板底部，且不留缝隙。洁净医学实验室吊顶空间较大的区域，其顶棚装修材料应为不燃材料且吊顶的耐火极限不应低于0.5h。由于功能需要。有些局部区域具有较大的吊顶空间，为了保证该空间的防火安全性，故要求吊顶的材料为不然且具有较高的耐火极限值。在此前提下，可不要求在吊顶内设消防设施。
洁净医学实验室应设置火灾事故照明。屏障环境设施的疏散走道和疏散门，均应设置灯光疏散指示标志。火灾事故照明和疏散指示标志可采用蓄电池作备用电源，但连续供电时间不应少于20min。
洁净医学实验室的安全出口的数目不应少于2个。安全出口处应设置疏散指示标识和应急照明灯具。洁净医学实验室疏散通道门的开启方向，可根据区域功能特点确定。
洁净医学实验室可设自动喷淋装置，前提是一旦出现误喷不会导致该洁净医学实验室出现严重的污染后果、设备损坏、或者影响实验结果。洁净医学实验室应设消火栓、灭火器等灭火器材，洁净医学实验室内应设置消火栓系统且应保证两个水枪的充实水柱同时到达任何部位。洁净医学实验室的消火栓尽量布置在非洁净区，如布置在洁净区内，消火栓应满足净化要求，并应作密封处理，防止与室外直接相通，破坏屏障。
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