一、严格科学的管理是保证实验质的重要环节
从动物房的平面、净化设施等的设计到设施建设，全程在实验动物学会的专家指导下完成。每年坚持在实验动物环境设施合格证到期时，主动申请实验动物监测所的专家进行检测和指导，查明其中的问题与可能存在的隐患。同时，每年对屏障系统的内外环境进行自检，保证设施的正常运行。在加强硬件管理的同时，还制定了一系列的管理措施，从各方面保证动物房在符合质量体系要求的状况下有效运行。
二、制定SPF级动物房的管理制度和操作的作业指导书
为了保证SPF级动物房的正常运行，需制定整套科学可行的管理制度和相应的作业指导书，以规范日常的每一项工作，从而使SPF级动物房在符合要求的状况下正常运作。制定的规章制度和作业指导书有：《SPF级动物实验室管理操作规程》，《恒温恒湿系统操作规程》，《反渗透纯水系统操作规程》，《闭路监控系统操作规程》，《脉动真空蒸汽灭菌器操作规程》，《物品消毒操作规程》，《待检样品进入SPF级动物实验室操作规程》，《人员进入SPF级动物实验室操作规程》，(动物进入SPF级动物实验室操作规程》，《动物饲养操作规程》，(SPF级动物实验室内外环境消毒操作规程》，《实验动物管理操作规程》。
三、加强人员培训，提高职业素质
因工作关系需要进入SPF级动物房的实验人员和工作人员，必须通过相关的学习，在取得相关的从业资格证书后才能上岗。在日常的工作中，经常组织职工学习规章制度和业务知识，加强职工思想品德教育，提高对实验动物学科的认识。
四、严格执行工作人员体检制度
实验动物工作人员每年体检一次。患有传染性疾病特别是人畜共患病的，患病期间不得继续从事实验动物饲养、研究工作。
五、严格规定人员、物 品、动物的流向
严格遵循单向流动的原则。
人员流向：外环境→第一更衣→淋浴→第二更衣→风淋→洁净走廊→实验室→次洁净走廊→缓冲间→外环境
动物流向：购买SPF级动物→检疫/观察室→实验室→次洁净走廊→缓冲间→解剖室
物品流向：洗消间→高压灭菌设备/渡槽/传递窗→消毒物品储存室→实验室→次洁净走廊→缓冲间→外环境
六、合理选择消毒方法
根据进入SPF级动物房的各种物品的不同特性，选择不同的消毒方法。饲养笼盒、饮水瓶、垫料、衣服和各种实验用具采用高压蒸汽灭菌器消毒；动物食用饲料采用放射性照射(60Co)的消毒方法；工作人员用的拖鞋等采用渡槽浸泡的方法(0.5%灭菌净溶液)消毒；对于不耐热、不耐水、不耐酸碱，和不能进行放射性照射的物品采用传递窗紫外线消毒。
七、保持设备的正常运行，积极开展各项指标的检测工作
经常对空调通风系统进行保养，每1~2周更换排风口过滤膜，每两个月更换一次初效和中效过滤袋，每年更换一次高效过滤膜；每半年检测一次外购伺料的微生物指标和营养成分，每半年检测一次纯净水的微生物指标；每天对温湿度、压差等进行监测。
八、认真做好屏障环境
内外的清洁消毒工作保持屏障环境内的洁净度是SPF级动物房正常运行的.关键。每天的实验和饲养工作完成后，对室内环境进行清洁，每周3次用灭菌净消毒水对整个屏障系统的内环境和饲养笼架进行消毒。
九、做好日常各项登记工作
设立《人员进出登记本》、《物品进出登记本》、《动物实验登记本》.《实验室环境指标登记本》，认真做好每一天的记录；建立实验动物数据库，对每批购买的动物的来源、品种、数量、体重、合格证号和检疫情况进行详细记录，并可随时在电脑中查阅。
十、妥善处理动物尸体
动物实验结束后，将动物处死，暂时存放在-20℃的冰箱内，统一送卫生处理厂作焚烧处理。
十一、运行中存在的问题及建议
1.环境条件的保持
在气候温暖潮湿的地区，采用全新空调通风系统对于温湿度的控制有一定的困难，如在进风口处增加一套预冷除湿设备将有效提高整个系统的性能。
2.饲料的营养成分
不论采用放射性照射还是高温高压的方法对动物的饲料进行消毒，都不可避免地会使部分营养成分减少，特别是各种维生素。因此，必须经常在饲料和饮水中补充鸡蛋、瓜子和多种维生素，从而确保实验动物的营养和健康。
3.人员与操作的问题
实验人员和其他工作人员进入动物房前，更衣淋浴工作较难进行控制；淋浴间的湿度较大，容易导致细菌的生长繁殖；工作人员是否严格按照规范穿着专用的工作服等等，这.些因素都会对环境造成一定的影响。因此，应经常对职工进行职业道德教育，加大管理力度。
4.能源节约问题
屏障系统24 h全天候运作，过滤器、紫外灯、特制的饲养笼具需经常进行更换，水电费的巨额支出等，使得维护保养的费用很大。如何节约能源，有效降低运行成本是维持SPF级动物房长久运作的一个不可回避的问题。
随着《实验动物许可证管理办法》的实施，动物实验的要求不断提高，实验动物的管理将逐步加强，实验动物屏障设施的使用也越来越广泛，因此，在SPF级动物房的设计与建设时，应组织专家进行论证，尽可能减少现有问题的重复出现，同时应将节约能源的问题摆在重要的位置。
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