1.送风系统
空调净化系统设置粗、中、高三级空气过滤。第一级是粗效过滤器，对于≥5μm大气尘的计数效率不低于50%，设置在空调机组的人口处。第二级是中效过滤器，设置在空调机组的出口处。第三级是高效过滤器，设置在系统末端的高效送风口内。另外在5层的两套全新风空调机组的表冷器前，各设置一道保护用的中效过滤器。
高效过滤送风口前安装一个定风量调节阀，主要是因为高效过滤器会因为灰尘的积聚引起阻力的增加比较大，进而引起送风量的减小，最后导致室内压力被破坏。安装定风量调节阀可以弥补这方面的损失，最大限度的恒定室内压力。
2.排风系统
本设计采用的排风方式，是生物安全柜排风和房间排风共用一个排风系统。当生物安全柜不工作时，变风量调节阀b关闭，变风量调节阀c全开。当生物安全柜工作时，根据生物安全柜的开度变风量调节阀b，c自动调节到预先设定好的风量。
相比生物安全柜排风和房间排风分设排风系统，这样做有以下优点。
第一，排风过滤机组的风量可以恒定设置(即保持通风柜排风和房间排风之和恒定)，这样排风过滤机组的选型和风量控制都比较容易。
第二，由于排风总量是恒定的，所以送风总量也可以恒定设置，这样既节约投资，房间内的压力控制也比较可靠。
第三，少设一套排风机组不仅节约了投资和运行维护成本，也减少了设备摆放空间。这点也许从单间实验室来看并不明显，但对整个实验楼大量的实验室来说可以节约不少资金，更重要的是还节约了大量的设备摆放空间。
不过这里要注意的是电动密闭阀a(必要时可手动操作)是必须的，在排风过滤机组关闭时它必须同时关闭。这是因为生物安全柜和室内实际上通过排风管道是联通的，当排风过滤机组运行的时候排风管内是处于负压状态，生物安全柜内的气体不会通过排风管道倒流到室内。而当排风过滤机组关闭时，就必须关闭电动密闭阀a，来防止生物安全柜内的气体通过排风管道倒流到室内。
最后说明一下，排风系统中的过滤器设置为高中效过滤器，并且设置在末端的排风过滤机组内，主要目的是减小室外空气渗入室内对洁净度的影响。因为这毕竟只是二级生物安全实验室，里面有害物质的危害性并没有三级生物安全实验室那么大。所以无需在室内排风口处设置高效过滤器，这不仅仅是考虑节约投资，更主要的是高效过滤器更换比较频繁，且更换工作烦琐，会影响正常实验的进行，另外高效过滤器阻力变化大，会使风量产生波动从而影响压差的控制。
3.压力控制
二级净化生物安全实验室(涉及有毒有害挥发性溶媒和化学致癌剂)的压力控制是比较特殊的。如果全采取负压，必然会导致室外非洁净区空气压人室内洁净区，从而导致净化效果被破坏；但如果全采取正压，也会导致室内污染区空气直接压人室外清洁区，从而带来安全隐患。
本设计采用了压力控制方式，以更衣为正压陷阱。向内压人实验区，保证实验室的负压；向外压入非净化区，保证实验室的洁净度。特别说明一下，一般来说更衣和缓冲做到8级(10万级)就可以了，但为了保证不使低级别净化室的空气流人高级别净化室，这里把更衣和缓冲提高到了7级。
涉及有毒、有害、挥发性溶媒和化学致癌剂的二级净化生物安全实验室，是二级生物安全实验室的一种特例。我们在设计中既要考虑到同一般的二级生物安全实验室相比，它有较高的洁净要求，同时也要求在全排风的情况下保证一定的负压。但也不能以三级生物安全实验室的指标来要求它，从而避免不必要的浪费。
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