为了特定目的而在室内造成一定的空气流动状态与分布，通常叫做气流组织。一般来说，空气自送风口进入房间后首先形成射入气流，流向房间回风口的是回流气流，在房间内局部空间回旋的则是涡流气流。为了使工作区获得低而均匀的含尘浓度，洁净室内组织气流的基本原则是：要最大限度地减少涡流；使射入气流经过最短流程尽快覆盖工作区，希望气流方向能与尘埃的沉降方向一致；使回流气流有效地将室内灰尘排出室外。可见洁净车间与一般的空调车间相比是完全不同的。洁净室的气流组织形式和换气次数的确定，应根据热平衡、风量平衡以及净化要求计算而得到，并取最大值。
洁净室的气流组织形式是实现净化环境的重要保证措施。一般气流组织形式有非层流方式或层流方式两种。用高度净化的空气把车间内产生的粉尘稀释，叫做非层流方式(乱流方式)。用高度净化的气流作为载体，把粉尘排出，叫做层流方式。层流方式有垂直层流和水平层流两种。从房顶方向吹入清洁空气通过地平面排出叫垂直层流式，从侧壁方向刮入清洁空气，从对面侧壁排出叫水平层流式。乱流方式由于换气次数的变化洁净度也随之变化，但通常洁净度要求10000级时，换气次数在25~35次/小时范围内；洁净度要求100000级时，换气次数在15~25次/小时范围内；洁净度要求300000级时，换气次数在12~18次/小时范围内。层流方式通常规定了气体流速为0.25~0.5M/S。
1.乱流方式的优点：
1)过滤器以及空气处理简便；
2)设备投资费用较低；
3)扩大生产规模比较容易；
4)与净化工作台联合使用时，可以保持较高的洁净度。
2.乱流方式的缺点：
1) 室内洁净度易受作业人员的影响；
2)易产生涡流有污染微粒在室内循环的可能；
3)换气次数低，因而进入正常运转的时间长、动力费用增加；
3.垂直层流式的优点：
1)不受室内作业人数作业状态的影响，能保持较高的洁净度；
2)换气次数高，几乎在运转的同时就能达到稳定状态；
3)尘埃堆积或再飘浮非常少，室内产生的尘埃随气流运行被除去，迅速从污染状态恢复到洁净状态。
4.垂直层流式的缺点：
1)安装终滤器以及交换板麻烦，易导致过滤器密封胶垫破损；
2)设备投资费用较高；
3)扩大生产规模困难。
5.水平层流方式的优点：
1)因涡流、死角等原因使尘埃堆积或再飘浮的机会相对减少；
2)换气次数高，因而自身净化时间短；
3)室内洁净度不大受作业人数和作业状态的干扰。
4)需要完善的衣帽间、工作服清洗间、更衣室、风淋室等缓冲系统。
6.水平层流方式的缺点：
1)受风面近能保持高洁净度，但接近吸风面，洁净度则随之降低；
2)扩大生产规模困难；
3)设备投资费用较高；
4)需要完善的衣帽间、工作服清洗间、更衣室、风淋室等缓冲系统。
从上述分析可以看出：若把操作室全部净化系统设计成上述层流的方式，则设备和附加工程投入费用较高，因此，在这种情况下可以考虑采用局部层流净化方式。这样对洁净车间大面积的环境洁净级别就可以不需要那么高，而且实际上要使一个洁净车间的全部洁净度均都达到100级是很困难的。
在洁净室内一般采用上送下回的送回风方式。上送上回的送回风方式虽然在某些空态测定中可能达到设计的洁净度级别的要求，但是在动态时很不利于排除污染，所以是不宜推荐的方式，这是因为：
1)上送上回容易形成某一高度上某一区域气流趋向停滞，当使微粒的上升力和重力相抵时，易使大微粒(主要是5μm微粒)停留在某一空间区域，所以对于局部百级情况下不利于排除尘粒和保证工作区的工作风速；
2)容易造成气流短路，使部分洁净气流和新风不能参与室内的全部循环，因而降低了洁净效果和卫生效果；
3)容易使污染微粒在上升排出过程中污染其经过的操作点。导致给产品带来交叉污染。但是在洁净区走廊中由于没有操作点，如用上送上回则一般不存在这种危险。另外在洁净区其两边房间之间没有特别的交叉污染的条件下，或在30万级的低要求洁净室采用上送上回方式也是可以允许的。
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