化学消毒是指用化学消毒药物作用于微生物和病原体，使其蛋白质变性，失去正常功能而死亡。化学消毒是 SPF 级实验动物屏障最常用的消毒方法，化学消毒中使用的化学药品溶液为消毒剂。消毒剂的使用方式包括喷洒、浸泡擦拭、重蒸等。目前，SPF 级实验动物屏障常用的有氧化消毒剂、碘类消毒剂、醛类消毒剂、酚类消毒剂、醇类消毒剂、季胺类消毒剂、卤素消毒剂等。、氧化消毒剂氧化消毒剂是利用化学氧化作用，将病原微生物灭活或弱化，或者使之分解转化成其它形态。氧化消毒主要包括有臭氧、过氧乙酸、过氧化氢、高酸钾等,药化消毒剂对金属具有腐蚀性，并且大多数氧化消毒剂会散发出强烈的刺激性气味，常被用于 SPF 级实验动物屏障建筑设施、防腐蚀物品的消毒。
醛类消毒剂
醛类消毒剂是使用最早的一-类化学消毒，早在 1860 年 Butlero 就发现了甲醛，1888 年 Loew 第一次报道了甲醛的灭菌特性: 液体和气体均具有较好的杀灭冬种细菌和细菌芽抱以及杀灭病毒的作用。醛类消毒剂由于杀菌力强，性能稳定，容易储存和运输，腐蚀性小，可用于金属器械的消毒，且对有机物的影响小，在SPF 级实验动物屏障整体消毒作用巨大。甲醛是最好的醛类熏蒸消毒剂，但甲醛气体消毒穿透力较差，在甲醛熏蒸消毒时，应把需消毒的物品尽量散开暴露，让挥发的甲醛充分与物品接触。实验室通常选用 40%甲醛溶液，按照 2mlm3 进行喷雾消毒，作用 24h 之后即可达到杀灭细菌的效果。甲醛熏蒸消毒时，受温度和气体消毒穿透力较差，在甲醛熏蒸消毒时，应把需消毒的物品尽量散开暴露，让挥发的甲醛充分与物品接触。实验室通常选用 40%甲醛溶液，按照 2ml/m3 进行喷雾消毒，作用 24h 之后即可达到杀灭细菌的效果。甲醛熏蒸消毒时，受温度和湿度的影响很大，熏蒸环境温度越高消毒效果越好，温度每升高 109C，消毒能力可提高2~4倍。甲醛经常与高酸钾和水配合消毒作用巨大,依次按照 1:1.3:1.6的比例配制，用于 SPF 级实验动物屏障实验室进行彻底消毒。要求环境温度应尽量控制在 20C以上，空气相对湿度达到 80%~90%，其消毒作用才能得以充分发挥。
三、醇类消毒剂
醇类能使病原微生物菌体蛋白凝固和脱水，而且具有溶脂的特点，更能渗人到细菌体内发挥杀菌作用。SPF 级实验动物屏障通常利用醇类中浓度为 75%的乙醇对非醇溶性物品进行擦拭消毒，例如对剪刀、镊子、电子等的消毒。四、季按盐类消毒剂本类消毒剂杀菌原理主要为改变细胞的渗透性，使菌体破裂，使蛋白质变性，抑制细菌体内某些酶，以致使之失去活性。因其有良好的表面活性，可高浓度聚集于菌体表面，影响细菌的新陈代谢。常用于皮肤和 SPF 级实验动物屏障环境表面消毒，一般用单链委盐消毒剂按照 1000~2000m/L 进行浸泡、擦拭或喷洒消毒,作用时间 30min。皮肤消毒时选用 500~1000mg/L 进行擦拭或浸泡消，作用2~3min。屏障实际消毒运用中，季盐类消毒剂在针对病原微生物时，应该适当加大浓度，.新洁尔灭是季盐类消毒剂中的常用的代表消毒剂，其消毒最低浓度要求>0.1%，常见为喷洒和浸泡两和消毒方式。
五、卤素消毒剂
卤素消毒剂是目前世界上应用时间最古老、使用最广泛、杀菌效果十分理想的消毒剂之一，具有价格便宜、使用方便、广谱杀菌等优点。在养殖过程中合理选用卤素消毒剂能有效控制水体中病原微生物和藻类的数量，从而减少养殖动物的发病概率。卤素消毒剂能很容易渗透到细菌细胞内，对原浆蛋白产生卤化和氧化作用，最终杀灭整个细菌，常用的代表为含氯澳、碘等化合物制品。例如氯酸钙、氯化钙、氢氧化钙的混合物形成的漂白粉可以对 SPF 级实验动物屏障内更换出来的废弃物及动物饮水瓶消毒:癸甲澳溶液为是屏障中日常最常使用化学消毒剂，通常是将原液浓度为 1%的癸甲澳溶按照 1:100 进行稀释喷雾或浸泡消毒;碘类消毒剂是以碘主要杀菌成分制成的各种消毒制剂。SPF 级屏障常用单质碘与聚乙烯叱咯烷酮的不定型结合物一碘伏，利用含有效碘 1%碘伏溶液进行地面喷雾和饲养架擦拭消毒。通常情况下，作用 15min 就可杀灭多种细菌和
病毒，包括细菌芽抱，真菌和亲水病毒
六、酚类消毒剂
酚类消毒剂最常见的消毒剂为来苏尔、来苏尔甲酚、植物油、氢氧化钠的皂化液。市场，上常用的酚类消毒剂为甲酚含量 50%的甲酚皂消毒液，其颜色主要为无色或黄色液体。具体使用方法和范围为:1~2%溶液用于手和皮肤消毒时，使用前务必确定浓度量，以防损伤手和皮肤: 3~5%溶液用于器械物品消毒和5~10%溶液用于实验动物排泄物的消毒。
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